لدر DNA

لدر DNA (نردبان DNA) محلولی حاوی مولکول‌های DNA با طول‌های مختلف است. از این محلول در الکتروفورز ژل آگاروز یا آکریل‌آمید به عنوان مرجعی برای تخمین اندازه مولکول‌های DNA ناشناخته استفاده می‌شود.

لدر DNA چه کارایی دارد؟

در الکتروفورز، مولکول‌های DNA بر اساس اندازه و بارشان در میدان الکتریکی جداسازی می‌شوند. مولکول‌های DNA کوچکتر سریع‌تر حرکت می‌کنند و مسافت بیشتری را در ژل طی می‌کنند، در حالی که مولکول‌های DNA بزرگتر کندتر حرکت می‌کنند و مسافت کمتری را طی می‌کنند.

نحوه بارگذاری لدر

لدر شامل نوارهایی از DNA با اندازه‌های مشخص است. هنگامی که لدر DNA به همراه نمونه‌های DNA ناشناخته روی ژل بارگذاری می‌شود، نوارهای DNA در لدر به عنوان نقطه مرجع برای تخمین اندازه مولکول‌های DNA ناشناخته عمل می‌کنند.

اندازه لدر DNA

لدرهای DNA معمولاً حاوی 10 تا 15 نوار DNA با اندازه‌های مختلف هستند که از 100 جفت باز تا 10 کیلوباز متغیر است. برخی از لدرها دارای نوارهای رنگی هستند که به منظور شناسایی آسان‌تر نوارها اضافه شده‌اند.

انواع لدر

دو نوع رایج لدر DNA عبارتند از:

• لدر DNA 100bp: این نوع لدر برای تخمین اندازه مولکول‌های DNA دو رشته‌ای در محدوده 100 جفت باز تا 1500 جفت باز استفاده می‌شود.
• لدر DNA 1kb: این نوع لدر برای تخمین اندازه مولکول‌های DNA دو رشته‌ای در محدوده 100 جفت باز تا 10 کیلوباز استفاده می‌شود.

کاربردهای لدر

لدر DNA در کاربردهای مختلف زیستی مولکولی از جمله:

• بررسی خلوص DNA: می‌تواند برای بررسی خلوص نمونه DNA با مشاهده اینکه آیا باندهای تیز و مشخصی در ژل ایجاد می‌کند یا خیر، استفاده شود.
• تعیین اندازه قطعات DNA: می‌تواند برای تعیین اندازه قطعات DNA که با استفاده از آنزیم‌های محدود کننده هضم شده‌اند، استفاده شود.
• شناسایی جهش‌ها: می‌تواند برای شناسایی جهش‌ها در DNA استفاده شود، زیرا جهش‌ها می‌توانند باعث ایجاد تغییراتی در اندازه قطعات DNA شوند.
• بررسی کارایی انتقال: می‌تواند برای بررسی کارایی انتقال قطعات DNA به غشای در تکنیک Western blot استفاده شود.

خلاصه

لدر ابزاری ضروری برای تخمین اندازه مولکول‌های DNA در آزمایشگاه‌های ژنتیک مولکولی است. لدرهای DNA در انواع مختلف با طول‌های مختلف نوار DNA موجود هستند و می‌توان از آنها در کاربردهای مختلفی از جمله بررسی خلوص DNA، تعیین اندازه قطعات DNA، شناسایی جهش‌ها و بررسی کارایی انتقال استفاده کرد.