لدر پروتئین

لدر پروتئین، که به آن نشانگر وزن مولکولی پروتئین یا مارکر پروتئینی نیز گفته می‌شود، مخلوطی از پروتئین‌های با وزن مولکولی شناخته شده است. این پروتئین‌ها در ژل الکتروفورز SDS-PAGE به طور جداگانه مهاجرت می‌کنند و باندهای مجزا با وزن‌های مولکولی مشخص ایجاد می‌کنند.

کاربردهای لدر پروتئین

• تعیین وزن مولکولی پروتئین‌های ناشناخته: با مقایسه محل مهاجرت باند پروتئین ناشناخته با باندهای لدر پروتئین، می‌توان وزن مولکولی آن را تخمین زد.
• بررسی جداسازی پروتئین‌ها در ژل: لدر پروتئین به عنوان یک کنترل عمل می‌کند و نشان می‌دهد که آیا جداسازی پروتئین‌ها در ژل به درستی انجام شده است یا خیر.
• تخمین مقدار پروتئین: با مقایسه شدت باند پروتئین ناشناخته با باندهای لدر پروتئین، می‌توان مقدار آن را به طور تقریبی تخمین زد.

انواع لدر پروتئین

لدرها در طیف‌های مختلف وزن مولکولی موجود هستند. رایج‌ترین نوع لدر، لدر با محدوده وزنی گسترده است که شامل پروتئین‌هایی با وزن مولکولی بین 10 تا 230 کیلو دالتون است. لدرهای پروتئینی با محدوده وزنی باریک نیز موجود هستند که برای تخمین دقیق‌تر وزن مولکولی پروتئین‌های خاص استفاده می‌شوند.

نکاتی در مورد استفاده از لدر 

• قبل از استفاده، لدر را به دمای اتاق برسانید.
• لدر را با بافر نمونه مخلوط کنید.
• حجم ثابتی از مخلوط لدر را به هر چاه ژل نمونه اضافه کنید.
• پس از اتمام الکتروفورز، ژل را با رنگ آمیزی مناسب رنگ آمیزی کنید.

مزایای لدر پروتئینی

• دقت: لدرهای پروتئینی ابزار قابل اعتمادی برای تخمین اندازه پروتئین هستند، به خصوص زمانی که از لدرهای با کیفیت بالا استفاده شود.

• سهولت استفاده: لدرهای پروتئینی به طور آماده استفاده می‌شوند و می‌توان آنها را به طور مستقیم روی ژل الکتروفورز بارگذاری کرد.

• تنوع: لدرهای پروتئینی در طیف وسیعی از محدوده‌های وزن مولکولی موجود هستند تا نیازهای مختلف آزمایشگاهی را برآورده کنند.

• قابلیت مشاهده: باندهای لدر پروتئینی معمولاً با رنگ‌های مختلف نشان‌دار می‌شوند که به منظور مشاهده آسان آنها در ژل یا غشای PVDF طراحی شده‌اند.

• کاربردهای چندگانه: لدرهای پروتئینی را می‌توان برای طیف وسیعی از تکنیک‌های مختلف از جمله الکتروفورز SDS-PAGE، ایزوالکتریک فوکوسینگ و وسترن بلاتینگ استفاده کرد.

در مجموع، لدرها ابزارهای ضروری برای زیست‌شناسان مولکولی، بیوشیمیست‌ها و سایر محققان هستند که با پروتئین‌ها کار می‌کنند. آنها روشی قابل اعتماد، آسان و متنوع برای تخمین اندازه پروتئین، بررسی جداسازی پروتئین و نظارت بر انتقال در وسترن بلاتینگ ارائه می‌دهند.